Игровой движок не позволяет переименовывать или создавать города (хотя в
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться] - Kingdoms, в Американской кампании, города переименовывались, если их захватывали европейцы у индейцев и наоборот), поэтому, в 1700 году, в игре уже присутствует Санкт-Петербург, но он является столицей области Ингерманландия и контролируется Швецией.
В провинции Ингерманландия существует поселение под названием Кингисепп, хотя изначально эта крепость называлась Яма (Ям), а с 1703 по 1922 год это Ямбург.
В провинции Татария существует поселение Тольятти, хотя поселение на этом месте было основано только в 1737 году, до 1964 года именовалось Ставрополь.
В провинции «Земли войска донского» (это территория соответствует южному федеральному округу РФ) есть поселение Майкоп, этот город был основан в 1857 году и притом первоначально был не мирным поселением, а крепостью.
Хотя исторически первый пароход совершил свое плавание в 1807 году, игрок, последовательно развивая технологии, может получить возможность создавать пароходы уже в XVIII веке.
В Empire: Total War столицей России является Москва, а не Санкт-Петербург.
В Empire: Total War Зимний дворец и Кунсткамеру можно построить в Москве, но не в Санкт-Петербурге.
На упаковке Empire: Total War мундир бойца и флаги разные, в зависимости от той страны, в которой продается игра (В США — флаг США, в России — флаг Российской Империи, в Германии — флаг Пруссии).
Если устроить в стране революцию, то флаг страны поменяется (название государства остаётся прежним - например, Османская Империя даже после установления республики продолжает именоваться империей). У Империи Маратха, например, флаг меняется на индийский, а у Пруссии - на немецкий. На "революционном" флаге США вместо звёзд на красном поле присутствует белая корона.
Встречаются различные казусы с линейками войск - они и так достаточно однообразны, но и помимо того встречаются различные курьёзы. Например, Крылатые гусары у Дагестана, Галеры у европейских фракций, Казаки у Крымского Ханства, и т. п. Ещё одним минусом является отсутствие национальных одежд у некоторых фракций - например у России городское ополчение одето в береты и европейское убранство.
Во Франции, в Париже, можно построить Триумфальную арку, несмотря на то что она была закончена намного позже, в 1836 году.
В Empire Total War совершенно нет хоть какой-нибудь историчности в правящих династиях, например, Пётр I может дожить до 1779 и после него может начать править царевна/императрица Анна I.
Хотя Империя Великих Моголов неиграбельная фракция, если с помощью редактирования startpos.exe открыть их, то в меню выбора кампании будет присутствовать нормальное описание и в начале игры советник сообщит рекомендуемые действия, как в других компаниях.